文章摘要:【目的】明确广东地区鸭疫里默杆菌的血清型、耐药状况及遗传进化关系。【方法】从规模化鸭场分离鉴定鸭疫里默氏杆菌,通过玻片凝集试验鉴定血清型;利用试管两倍稀释法测试抗菌药物的最低抑菌浓度,分析药物的敏感性;采用全基因组测序技术分析序列特征并构建核心基因组遗传进化树。【结果】共分离鉴定鸭疫里默氏杆菌168株,血清1、2、3、5、6、7、8、10型均有流行,高达54.17%(91/168)的菌株为血清1型,2型占27.97%(47/168);48株代表性菌株对庆大霉素、卡那霉素、盐酸环丙沙星表现高度耐药,耐药率均超过80%;对土霉素、盐酸四环素、盐酸金霉素、氧氟沙星、诺氟沙星、磺胺二甲氧嘧啶、磺胺对甲氧嘧啶的耐药率均在60%以上,对阿莫西林、头孢噻肟和大观霉素的耐药率低于30%;受试菌株对5~12种药物耐药,共有44种耐药谱型;46株成功获得全基因组序列,共检出6种耐药基因,其中耐药基因erm(F)和tet(X)的检出率较高,分别为73.91%(34/46)和82.60%(38/46),同时携带2种以上耐药基因的菌株占95.65%(44/46);18株菌株(39.13%)ST分型成功,分属11个ST型;所有测序菌株与数据库中来自中国的菌株在遗传进化关系上最接近,主要存在于优势克隆群系Clade 1和Clade 3。【结论】本研究在对RA分离株进行血清型和耐药性调查的基础上,结合全基因组测序数据对耐药基因、ST分型、遗传进化树作进一步分析,发现分离株的优势血清型为1型,耐药性严重,所携带的耐药基因与耐药表型具有一定相关性,ST型呈多样性,与来自我国的菌株遗传背景相近,研究结果为疫苗免疫预防与药物治疗及掌握遗传进化特征提供依据。
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